A+醫(yī)學(xué)百科 >> 開放閱讀框

開放閱讀框（英語：Open reading frame；縮寫：ORF；其他譯名：開放閱讀框架、開放讀架等）是指在給定的閱讀框架中，不包含終止密碼子的一串序列。這段序列是生物個體的基因組中，可能作為蛋白質(zhì)編碼序列的部分。基因中的ORF包含并位于開始編碼與終止編碼之間。由于一段DNA或RNA序列有多種不同讀取方式，因此可能同時存在許多不同的開放閱讀框架。有一些電腦程式可分析出最可能是蛋白質(zhì)編碼的序列。

目錄 1 例子 2 找ORF的軟件 2.1 功能 3 參見 4 外部連結(jié) 5 參考來源

例子

一段5'-UCUAAAGGUCCA-3'序列。此序列共有3種讀取法：

1. UCU AAA GGU CCA
2. CUA AAG GUC
3. UAA AGG UCC

由于UAA為終止編碼，因此第三種讀取法不具編譯出蛋白質(zhì)的潛力，故只有前兩者為開放閱讀框架。

找ORF的軟件

在線尋找ORF的軟件：ORF Finder

功能

ORF Finder 被用來預(yù)測已存在的編碼區(qū)的小基因序列。也可用于大規(guī)模的開放式閱讀框尋找。

參見

• 閱讀框架

外部連結(jié)

• Translation and Open Reading Frames - A Site explaining Open Reading Frames
• NCBI ORF finder - A web based interactive tool for predicting and analysing ORFs from nucleotide sequences.
• ORF finder - A web based interactive tool for predicting and analysing ORFs from nucleotide sequences - hosted at bioinformatics.org
• Sequerome - A Sequence profiling tool that links each BLAST record to the NCBI ORF enabling complete ORF analysis of a BLAST report
• StarORF - 多平臺， Java根據(jù)，為預(yù)言和分析ORFs和得到反向補(bǔ)全序列的GUI工具

參考來源

• 維基百科-開放閱讀框

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