原核生物：細(xì)菌分類(lèi)（門(mén)和目） 革蘭氏陰性菌/ 細(xì)菌外膜 陸地菌 (伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)) 初細(xì)菌 異常球菌-棲熱菌門(mén) (異常球菌目, 棲熱菌目) · 綠彎菌門(mén) (厭氧繩菌目, 暖繩菌目, 綠彎菌目, 爬管菌目, 纖線桿菌目, 熱絲孢菌目, 熱微菌目, 球形桿菌目) 其他 滑行菌 熱脫硫桿菌門(mén) · 嗜熱細(xì)菌 (產(chǎn)水菌門(mén) · 熱袍菌門(mén)) · 藍(lán)菌門(mén) 變形菌門(mén) (伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)) α-變形菌綱 柄桿菌目 · 基爾菌目 · 韓海研所菌目 · 短小盒菌目 · 根瘤菌目 · 紅桿菌目 · 紅螺菌目 · 立克次氏體目 · 史尼斯氏菌目 · 鞘脂單胞菌目 β-變形菌綱 伯克氏菌目 · 嗜氫菌目 · 嗜甲基菌目 · 奈瑟菌目 · 亞硝化單胞菌目 · 普羅卡桿菌目 · 紅環(huán)菌目 γ-變形菌綱 酸硫桿狀菌目 · 氣單胞菌目  · 交替單胞菌目 · 心桿菌目 · 著色菌目 · 腸桿菌目 · 軍團(tuán)菌目 · 甲基球菌目 · 海洋螺菌目 · 巴斯德氏菌目 · 假單胞菌目 · 咸水球形菌目 · 硫發(fā)菌目 · 弧菌目 · 黃色單胞菌目 δ-變形菌綱 蛭弧菌目 · 脫硫盒菌目 · 脫硫桿菌目 · 脫硫弧菌目 · 硫還原菌目 · 除硫單胞菌目 · 黏球菌目 · 互營(yíng)桿菌目 ε-變形菌綱 彎曲菌目 · 鸚鵡螺菌目 伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè) 螺旋體門(mén) 螺旋體綱 鞘脂桿菌超門(mén) (FCB組) 纖維桿菌門(mén) · 綠菌門(mén)(綠菌目, 慢桿菌目) · 擬桿菌門(mén) (擬桿菌目, 碳酸噬胞菌目, 黃桿菌目, 鞘脂桿菌目) 浮霉菌超門(mén)/ (PVC組) 衣原體門(mén) · 黏膠球形菌門(mén) (黏膠球形菌目, 食物谷菌目) · 浮霉菌門(mén) (藻球菌目, 浮霉?fàn)罹?/a>) · 疣微菌門(mén) (紫紅球菌目, 豐佑菌目, 土壤桿菌目, 疣微菌目) 其他革蘭氏陰性菌 酸桿菌門(mén) · 裝甲菌門(mén)(裝甲菌綱 · 土壤胞菌綱) · 嗜熱絲菌門(mén) · 產(chǎn)金菌門(mén) · 脫鐵桿菌門(mén) · 網(wǎng)團(tuán)菌門(mén) · 迷蹤菌門(mén) · 梭桿菌門(mén) · 芽單胞菌門(mén) · 硝化螺旋菌門(mén) · 互養(yǎng)菌門(mén) 革蘭氏陽(yáng)性菌/ 無(wú)細(xì)菌外膜 厚壁菌門(mén) (伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)) 芽孢桿菌綱 芽孢桿菌目 · 乳桿菌目 梭菌綱 梭菌綱 · 鹽厭氧菌目 · 熱厭氧桿菌目 · 鹽堿厭氧菌目 丹毒桿菌綱 丹毒桿菌目 熱石桿菌綱 熱石桿菌目 柔膜菌門(mén)/ 柔膜菌綱 支原體目 · 蟲(chóng)原體目 · 厭氧原體目 · 無(wú)膽甾原體目 · 嗜鹽體目 反壁菌綱 彎月單胞菌目 放線菌門(mén)/ 放線菌綱 (伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)) 放線菌亞綱 放線菌目 · 雙歧桿菌目 酸微菌亞綱 酸微菌目 紅蝽菌亞綱 紅蝽菌目 腈裂解菌亞綱 厄澤比氏菌目 · 腈裂解菌目 紅色桿菌亞綱 蓋亞菌目 · 紅色桿菌目 · 棲熱嗜獅菌目 · 土壤紅色桿菌目