霉菌(mould， mold)，亦稱“絲狀菌”，具有菌絲體或孢子體的小型真菌。體呈絲狀，叢生，可產生多種形式的孢子。多腐生。種類很多，常見的有根霉、毛霉、曲霉和青霉等。霉菌可用以生產工業原料(檸檬酸、甲烯琥珀酸等)，進行食品加工(釀造醬油等)，制造抗菌素(如青霉素、灰黃霉素)和生產農藥(如“920”、白僵菌)等。但也能引起工業原料和產品以及農林產品發霉變質。另有一小部分霉菌可引起人與動植物的病害，如頭癬、腳癬及番薯腐爛病等。
霉菌主要指廣布于土壤、水體、空中和霉變基物上的、具有重要經濟意義的腐生菌。它是多種類群真菌的俗稱，在分類學上沒有嚴格的定義。如：三葉草花藥霉是指噬花葡萄孢；黑霉是指黑曲霉；青或藍霉是指生在蘋果上的展青霉、生在柑橘上的意大利青霉和引起煙草藍霉病的煙草霜霉；面包霉是好食叢梗孢，也指生在面包上的毛霉目真菌；柑橘綠霉是指指狀青霉；灰霉是指灰葡萄孢；雪花蓮灰霉是指雪花蓮葡萄孢；針霉是指毛霉屬和其他接合菌綱的真菌；褐膏藥霉是指黃絲葚霉；白膏藥霉是指糞生節卵孢；雪霉是指北方核盤菌和核瑚菌；煙霉是指酵孢腔菌科和煤炱科的真菌；水霉是指水生鞭毛菌，特別是指水霉目的真菌。
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